Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2kQ63871 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2kQ63871 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2kQ63871 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2kQ63871 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2kQ63871 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Polr2kQ63871 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr2kQ63871 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr2kQ63871 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms