Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lcn4Q62472 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Lcn4Q62472 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lcn4Q62472 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
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