Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga3Q62470 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga3Q62470 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itga3Q62470 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga3Q62470 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms