Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp4Q62445 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sp4Q62445 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sp4Q62445 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms