Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl12Q62401 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl12Q62401 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl12Q62401 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms