Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tff3Q62395 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff3Q62395 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms