Protein–RNA interactions for Protein: Q62371

Ddr2, Discoidin domain-containing receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr2Q62371 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddr2Q62371 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddr2Q62371 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddr2Q62371 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms