Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sall3Q62255 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sall3Q62255 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Sall3Q62255 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sall3Q62255 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms