Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpcQ62241 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnrpcQ62241 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnrpcQ62241 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms