Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Six2Q62232 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Six2Q62232 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Six2Q62232 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Six2Q62232 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Six2Q62232 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Six2Q62232 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Six2Q62232 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Six2Q62232 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Six2Q62232 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Six2Q62232 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Six2Q62232 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Six2Q62232 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms