Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema5aQ62217 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema5aQ62217 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema5aQ62217 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms