Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ttf1Q62187 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttf1Q62187 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttf1Q62187 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.2 ms