Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Sema3cQ62181 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema3cQ62181 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema3cQ62181 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema3cQ62181 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema3cQ62181 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Sema3cQ62181 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema3cQ62181 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema3cQ62181 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Sema3cQ62181 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
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Sema3cQ62181 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Sema3cQ62181 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema3cQ62181 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema3cQ62181 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Sema3cQ62181 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema3cQ62181 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema3cQ62181 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema3cQ62181 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema3cQ62181 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sema3cQ62181 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema3cQ62181 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema3cQ62181 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema3cQ62181 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema3cQ62181 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema3cQ62181 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema3cQ62181 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema3cQ62181 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sema3cQ62181 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema3cQ62181 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sema3cQ62181 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Sema3cQ62181 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Sema3cQ62181 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sema3cQ62181 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Sema3cQ62181 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema3cQ62181 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Sema3cQ62181 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema3cQ62181 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sema3cQ62181 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Sema3cQ62181 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sema3cQ62181 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Sema3cQ62181 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Sema3cQ62181 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Sema3cQ62181 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema3cQ62181 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema3cQ62181 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema3cQ62181 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3cQ62181 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3cQ62181 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3cQ62181 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3cQ62181 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3cQ62181 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3cQ62181 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3cQ62181 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3cQ62181 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema3cQ62181 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema3cQ62181 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema3cQ62181 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema3cQ62181 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema3cQ62181 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema3cQ62181 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema3cQ62181 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Sema3cQ62181 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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