Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx3xQ62167 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx3xQ62167 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx3xQ62167 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms