Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprrQ62132 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprrQ62132 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PtprrQ62132 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprrQ62132 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprrQ62132 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprrQ62132 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PtprrQ62132 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PtprrQ62132 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PtprrQ62132 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprrQ62132 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PtprrQ62132 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprrQ62132 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprrQ62132 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprrQ62132 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PtprrQ62132 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprrQ62132 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprrQ62132 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PtprrQ62132 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PtprrQ62132 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PtprrQ62132 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PtprrQ62132 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PtprrQ62132 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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PtprrQ62132 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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PtprrQ62132 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PtprrQ62132 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
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PtprrQ62132 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PtprrQ62132 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprrQ62132 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PtprrQ62132 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprrQ62132 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprrQ62132 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtprrQ62132 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprrQ62132 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprrQ62132 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtprrQ62132 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PtprrQ62132 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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PtprrQ62132 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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PtprrQ62132 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprrQ62132 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprrQ62132 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprrQ62132 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprrQ62132 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprrQ62132 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PtprrQ62132 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PtprrQ62132 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprrQ62132 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprrQ62132 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprrQ62132 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprrQ62132 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PtprrQ62132 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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