Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Prm3Q62100 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prm3Q62100 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms