Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctr9Q62018 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ctr9Q62018 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ctr9Q62018 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ctr9Q62018 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms