Protein–RNA interactions for Protein: Q61805

Lbp, Lipopolysaccharide-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbpQ61805 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LbpQ61805 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LbpQ61805 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LbpQ61805 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LbpQ61805 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LbpQ61805 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LbpQ61805 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LbpQ61805 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LbpQ61805 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LbpQ61805 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LbpQ61805 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LbpQ61805 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LbpQ61805 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LbpQ61805 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LbpQ61805 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LbpQ61805 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LbpQ61805 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LbpQ61805 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LbpQ61805 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LbpQ61805 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LbpQ61805 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LbpQ61805 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LbpQ61805 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LbpQ61805 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LbpQ61805 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LbpQ61805 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LbpQ61805 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LbpQ61805 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms