Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pacsin1Q61644 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pacsin1Q61644 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pacsin1Q61644 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pacsin1Q61644 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms