Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc9a1Q61165 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc9a1Q61165 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slc9a1Q61165 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc9a1Q61165 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms