Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc1Q61056 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trpc1Q61056 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms