Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncor1Q60974 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncor1Q60974 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncor1Q60974 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncor1Q60974 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms