Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Meis1Q60954 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Meis1Q60954 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Meis1Q60954 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Meis1Q60954 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms