Protein–RNA interactions for Protein: Q60948

Mxd4, Max dimerization protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mxd4Q60948 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mxd4Q60948 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mxd4Q60948 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mxd4Q60948 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mxd4Q60948 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mxd4Q60948 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms