Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vdac1Q60932 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vdac1Q60932 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vdac1Q60932 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms