Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HellsQ60848 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HellsQ60848 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HellsQ60848 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HellsQ60848 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HellsQ60848 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HellsQ60848 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HellsQ60848 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HellsQ60848 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HellsQ60848 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HellsQ60848 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HellsQ60848 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HellsQ60848 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HellsQ60848 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HellsQ60848 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HellsQ60848 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HellsQ60848 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HellsQ60848 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HellsQ60848 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HellsQ60848 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HellsQ60848 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HellsQ60848 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HellsQ60848 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HellsQ60848 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HellsQ60848 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HellsQ60848 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HellsQ60848 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HellsQ60848 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HellsQ60848 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HellsQ60848 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HellsQ60848 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HellsQ60848 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HellsQ60848 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HellsQ60848 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms