Protein–RNA interactions for Protein: Q60771

Cldn11, Claudin-11, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn11Q60771 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn11Q60771 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn11Q60771 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn11Q60771 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms