Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
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PtprnQ60673 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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PtprnQ60673 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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PtprnQ60673 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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PtprnQ60673 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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PtprnQ60673 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PtprnQ60673 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PtprnQ60673 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprnQ60673 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PtprnQ60673 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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PtprnQ60673 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprnQ60673 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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