Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema5bQ60519 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema5bQ60519 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema5bQ60519 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms