Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY6

Fancb, Fanconi anemia group B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancbQ5XJY6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FancbQ5XJY6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FancbQ5XJY6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FancbQ5XJY6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FancbQ5XJY6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FancbQ5XJY6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FancbQ5XJY6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FancbQ5XJY6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FancbQ5XJY6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FancbQ5XJY6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FancbQ5XJY6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FancbQ5XJY6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FancbQ5XJY6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FancbQ5XJY6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FancbQ5XJY6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms