Protein–RNA interactions for Protein: Q5UW37

Cxcl17, C-X-C motif chemokine 17, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl17Q5UW37 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxcl17Q5UW37 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcl17Q5UW37 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl17Q5UW37 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl17Q5UW37 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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