Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E0

Lhfpl4, LHFPL tetraspan subfamily member 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl4Q5U4E0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lhfpl4Q5U4E0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lhfpl4Q5U4E0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms