Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim38Q5SZ99 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim38Q5SZ99 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim38Q5SZ99 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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