Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc42Q5SV66 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc42Q5SV66 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc42Q5SV66 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms