Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ctc1Q5SUQ9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ctc1Q5SUQ9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms