Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd40Q5SUE8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd40Q5SUE8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd40Q5SUE8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms