Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Sft2d1Q5SSN7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sft2d1Q5SSN7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms