Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam46cQ5SSF7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Fam46cQ5SSF7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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