Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
5730522E02RikQ5SP45 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
5730522E02RikQ5SP45 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5730522E02RikQ5SP45 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms