Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1C3

Trav3-3, T cell receptor alpha variable 3-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-3Q5R1C3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trav3-3Q5R1C3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trav3-3Q5R1C3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trav3-3Q5R1C3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms