Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCQ5

Dph1, 2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph1Q5NCQ5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dph1Q5NCQ5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dph1Q5NCQ5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dph1Q5NCQ5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms