Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Trim41Q5NCC3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
Trim41Q5NCC3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Trim41Q5NCC3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Trim41Q5NCC3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Trim41Q5NCC3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Trim41Q5NCC3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Trim41Q5NCC3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Trim41Q5NCC3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Trim41Q5NCC3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Trim41Q5NCC3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Trim41Q5NCC3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Trim41Q5NCC3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Trim41Q5NCC3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Trim41Q5NCC3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Trim41Q5NCC3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Trim41Q5NCC3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Trim41Q5NCC3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Trim41Q5NCC3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Trim41Q5NCC3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Trim41Q5NCC3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Trim41Q5NCC3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms