Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttf2Q5NC05 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ttf2Q5NC05 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms