Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Taf3Q5HZG4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Taf3Q5HZG4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf3Q5HZG4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Taf3Q5HZG4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Taf3Q5HZG4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms