Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH66

Xkr5, XK-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xkr5Q5GH66 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xkr5Q5GH66 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Xkr5Q5GH66 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xkr5Q5GH66 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xkr5Q5GH66 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xkr5Q5GH66 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xkr5Q5GH66 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xkr5Q5GH66 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xkr5Q5GH66 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Xkr5Q5GH66 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Xkr5Q5GH66 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms