Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hs3st6Q5GFD5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hs3st6Q5GFD5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hs3st6Q5GFD5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hs3st6Q5GFD5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hs3st6Q5GFD5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hs3st6Q5GFD5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hs3st6Q5GFD5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms