Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Q5EBG8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q5EBG8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q5EBG8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q5EBG8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q5EBG8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q5EBG8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q5EBG8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q5EBG8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q5EBG8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Q5EBG8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Q5EBG8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q5EBG8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms