Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp22Q5DU02 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp22Q5DU02 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp22Q5DU02 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms