Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp13Q5BKP2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp13Q5BKP2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms