Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ndufaf2Q59J78 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndufaf2Q59J78 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndufaf2Q59J78 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms